吡啶二羧酸：纳豆中的吡啶二羧酸，可以有效杀灭、抑制多种病原菌，尤其是O-157致病菌。对幽门螺旋杆菌有抑制作用。
溶菌酶：纳豆中的溶菌酶是母乳中能保护婴儿免遭病毒感染的一种有效成分，它能通过消化道而保持其活
性状态，溶菌酶还可以使婴儿肠道中大肠杆菌减少，促进双歧杆菌的增加，还可以促进蛋白质的消化吸收。
谷胱甘肽：纳豆中的谷胱甘肽具有抗氧化性，具有防止色素沉着功能，防治皮肤老化及色素沉着，也具有广谱的解毒作用，还具有抗过敏、护肝、保护白细胞的功能。
纳豆中的多种生理活性维生素是人体非常需要的，如维生素E、维生素B1、B2、B6、B12、维生素K2、叶酸、烟酸、肌醇、胡萝卜素、抗坏血酸等，这些维生素是参与代谢的必不可少的辅酶或辅基。
由于黄豆中矿物质的含量非常丰富，因此纳豆中的矿物质也非常丰富，有磷、钙、铁、锌、镁、钾、硒、镉、铜等，都是人体生命活动中用于催化的多种生理活性物质中不可或缺的辅酶或辅基。
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