人体对矿物质的吸收利用受到很多因素的影响，除矿物质不同态型影响其吸收利用和生物效应外，还有下述重要因素。
食物种类的影响：动物性食品比植物性食品不仅富含锌、铜、铁等必需微量元素，而且吸收利用率也比较高。如植物性食品中的锌元素所以不易被吸收，主要是由于植酸、纤维素以及草酸的影响。植酸能与锌形成难溶性的盐而不能被人体所吸收；植物纤维可降低锌的吸收率；草酸显然不影响锌的生物利用率，但草酸有协同纤维抑制锌吸收的作用。谷类、水果、蔬菜中的锌所以不易被吸收，就是由于植酸、纤维和草酸的影响。因而以谷物为主食的地区，摄入动物性食品少，往往容易造成锌缺乏症。
在谷类中，如全小麦、全糯米、全大米、全玉米等，虽然含锌量较高，但吸收利用率低。未发酵的面包、黑面包、玉米饼中的锌吸收也差。面粉中的植酸经发酵后可被破坏，从而提高锌的利用率。食品制作过程中，产生了植酸盐—蛋白质—锌复合物，也影响锌的吸收。
正常人乳中的锌主要与吡啶羧酸等小分子物质相结合，其吸收利用率较高。牛乳中的含锌量虽不亚于人乳，但其中的锌常与大分子蛋白质相结合，不易被吸收。因而人工喂养的婴幼儿，要特别警惕防止缺锌。以上是以锌为例说明食物种类和矿物质吸收的关系。其他元素的吸收利用也有类似的问题。
离子间的相互作用也会影。向微量元素的吸收利用。如由于钙和锌在吸收过程中有相互竞争的特性，所以在饮用硬水的地区，水中钙含量高，影响锌的吸收和运转。铜、锌吸收亦有竞争性拮抗作用，因而临床上评价铜、锌营养时，除了测定血清锌值和血清铜值之外，还十分注意它们之间的比值，这对临床诊断和治疗都有意义。铁与锌在人体内也有相互抑制的作用。镉能干扰锌的吸收。
补锌干扰铜吸收；补铁抑制锌吸收；缺铜影响铁的运转与释放；铁占据运铁蛋白影响铬的转运；铜、钴、砷可抑止亚铁络合酶，阻止铁与原卟啉合成血红素，导致红细胞内缺铁而骨髓铁沉积。红细胞内锌。非必需或有毒矿物质元素镉、汞、银可干扰铜的吸收，铅干扰锌与铁的利用。常量元素钙、磷可干扰铁、铜的吸收利用，硫离子和多价磷酸盐分别与铜、锌结合形成难溶性复合物，影响后者吸收。
此外，矿物质元素的化学价对人体吸收和利用也有很大的关系。如二价铁比三价铁吸收好。三价铬的存在形式是人体必需而无害的，而六价铬则有相当强的毒性及致癌性。
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